Cell | 线粒体激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性

2021-12-06 01:12:38 来源:
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线粒体在结构上通过加强或诱发该在结构上的激活可以控制测序组的功能和细胞身分确认。这些线粒体在结构上里存在特定的丝氨酸翻译后词句(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定激活精神状态彼此之间关,并可加强外周基因在结构上的成M-,影响测序的表达。为了在作用于时即使如此保持测序表达程序的完整性,决定线粒体在结构上的分子亦会特征也必需在子代细胞里确立。确立各有不同类M-线粒体精神状态的关键都和是丝氨酸PTMs,主要存在于丝氨酸H3和H4的鬃毛上。因此,在作用于的流程里,除了DNA副本,流感病毒核小体也必需修复,并分派到子代细胞里。确实,深入研究见到流感病毒的精华丝氨酸(比如副本依赖性的丝氨酸)亦会在副本叉后不断重新组装。各有不同的深入研究组见到H3K9me3和H3K27me2/3可通过体细胞表现M-。然而,这两个丝氨酸词句都是与外周线粒体在结构上彼此之间关。那么,流感病毒里的核小体,以及它们携带的丝氨酸PTMs否都能表现M-到子代细胞大致彼此之间同的测序观众席上呢?来自纽约大学兰戈恩医学里心的Danny Reinberg教授课题组在Cell刊登深入研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该深入研究见到在DNA副本时,作用于与深受诱发线粒体周围的核小体转化是各有不同的。深受诱发线粒体在结构上里的核小感深受被安顿在子代细胞大致彼此之间同的测序周围,而作用于M-线粒体在结构上里的核小体的分派则是高能量和随机的。为深入研究核小体的转化情况,深入研究者在候选测序观众席不可逆标有丝氨酸H3.1和H3.2,以豚鼠生殖体细胞里核小体在作用于时的变动。恰当来说,该方法通过位处蛋白标有技术,利用CRISPR为特定测序观众席的H3.1和H3.2;还有谷氨酸标有,经ChIP-qPCR检查该谷氨酸标有在线粒体G1期和S期的轻元素,以反应核小体的转化情况。若该残基H3.1和H3.2上的谷氨酸标有在一次作用于后下降一半,解释该核小体被安顿在了两个子代细胞的大致彼此之间同测序观众席上;若该谷氨酸词句很快消失,解释子代细胞并未表现M-该测序观众席的核小体。深入研究者首先检查了在生殖体细胞里心碎表达的Hoxc6, Ebf1, Meis2测序的核小体转化情况。这些测序观众席的核小体谷氨酸水平随作用于日趋缩减到,这若有深受诱发的测序观众席的核小感深受被安顿在子代细胞的大致彼此之间同位置。这与长处见到的H3K9me3和H3K27me2/3可通过体细胞表现M-的成因彼此之间印证。那么,作用于M-线粒体周围的核小体又是如何转化的呢?深入研究者检查了在生殖体细胞里被作用于表达的Ccna2, Nanog和Pou5f1测序,见到该测序观众席的谷氨酸标有在作用于后呈高能量精神状态,轻元素大幅提高,这若有对于作用于M-线粒体周围来说,流感病毒核小体没有准确的分派到子代细胞除此以外的测序观众席,而是随机分派的。更有趣的是,在可借生殖体细胞分化时,Hoxc6测序由诱发转为作用于,它的核小体分派模式也由准确的同残基分派改为随机分派。这解释流感病毒核小体的大面积分派,可以反映该线粒体周围的活性精神状态。总的来说,该深入研究通过CRISPR正向的丝氨酸谷氨酸标有管理系统,深入研究了核小体在作用于流程里的等价,并见到作用于与深受诱发的线粒体周围的核小体等价的各有不同。值得注意的是,在线粒体的S期里,深受诱发的线粒体周围的副本要晚于作用于M-线粒体周围。这个星期不同种也随之而来最常线粒体的副本速率大于异种线粒体。异种线粒体比起较慢的副本加速可能保证了核小体的准确分派,而最常线粒体里的PTMs则由除此以外的主诱发因子(master regulators)直接辨认除此以外DNA氨基酸,并招募PTMs酵素重新确立。原始应是:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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